Экологический внутренний аудит  - это аудит природоохранной деятельности внутри предприятия. 

Организация создает на объекте систему контроля за соблюдением порядка ведения документации, соответствия этих документов и деятельности действующему законодательству и нормативно-правовым актам в области охраны окружающей среды, выполнением поставленных целей и задач касательно природоохранной деятельности предприятия.

В ходе экологического аудита рассматриваются следующие проблемы:

• Соответствие природоохранной документации и деятельности предприятия  природоохранным требованиям
• Эффективность системы экологического менеджмента (если она внедрена)
• Определение вреда природной (окружающей) среде от загрязнения
• Оценка рациональности природопользования предприятия
• Определение эффективности природоохранных мероприятий и результативности использования средств, выделенных на природоохранную сферу
• Оценка достижения поставленных целей и показателей в области охраны окружающей среды
• Оценка экологического риска в результате техногенных аварий и стихийных природных процессов
• Выявление экологических проблем предприятия и разработка мероприятий по их решению, определение новых экологических целей, анализ динамики воздействия на окружающую среду.

Благодаря внутреннему аудиту предприятие запланированно периодически контролирует деятельность организации, выявляет слабые места, разрабатывает мероприятия, которые снижают экологические и техногенные риски.